Q：DNA 產(chǎn)量低
A：
? 裂解不充分：減少起始材料的用量。檢查樣品中是否加入了 Proteinase K溶液。如果提取的材料為動(dòng)物組織，盡量將組織切碎，并要保證材料完全浸泡在裂解液中。適當延長(cháng)裂解時(shí)間。
? 提取材料質(zhì)量不好：盡量選用新鮮材料，樣品采集后應盡快保存在 -70℃或液氮中。DNA 的產(chǎn)量取決于材料的種類(lèi)和幼嫩程度。
? 離心柱堵塞：過(guò)柱前檢查裂解液是否清亮，去除溶液中過(guò)于粘稠的不溶物。
? 洗滌溶液中未添加無(wú)水乙醇。必須在洗滌溶液中添加合適比例的無(wú)水乙醇。
? 洗脫條件不合適：洗脫液 EB 或超純水最好預先加熱至 70℃，用超純水洗脫前應檢查其pH 值是否在 7.0-8.5 之間，如 pH 值小于 7 將明顯影響洗脫效率，需調節后再進(jìn)行洗脫。洗脫液應盡量加到離心柱的中央，在離心前室溫靜置 1 分鐘。
? DNA 斷裂或降解：避免因移液槍反復吹吸或反復凍融樣品造成的 DNA 損傷。避免在操作過(guò)程中帶入外源 DNase 污染。
Q：洗脫液顏色發(fā)黑或硅膠膜脫色 ( 動(dòng)物組織或鼠尾材料 )
A：來(lái)源于組織的色素大量結合在離心柱上并與 DNA 一并洗脫：在過(guò)柱前檢查是否已加入乙醇，乙醇可防止色素與硅膠膜結合。在裂解液結合步驟可適當加大轉速和延長(cháng)離心時(shí)間。
? RNA 污染：可在樣品材料制備過(guò)程中添加適量的 RNase A 降解 RNA。
Q：影響下游的酶切
A：
? 純化的 DNA 中有乙醇殘留：在洗滌步驟中可能會(huì )帶來(lái)乙醇的殘留。加入洗脫液之前將離心柱在最大轉速下離心 2-3 分鐘徹底干燥離心柱。
? 純化的 DNA 中有鹽分殘留：采用正確的洗滌操作步驟，用不同 CB 溶液洗滌后再用 WB 洗滌。
