mNGS病原微生物檢測解決方案

病原微生物可以侵犯人體，引起感染病或傳染病，一直備受臨床關(guān)注。新型冠狀病毒肺炎全球大流行，給世界經(jīng)濟和人類(lèi)健康帶來(lái)嚴峻挑戰，更讓病原的精準快速檢測成為社會(huì )迫切的需求。

 宏 基 因 組 測 序 （metagenomics next?generation sequencing，mNGS）是基于高通量測序技術(shù)對各種臨床樣本中的全部生物基因組進(jìn)行測序的實(shí)驗室診斷技術(shù)，與其它常見(jiàn)微生物鑒定方法相比具有通量大、可同時(shí)檢測上萬(wàn)種微生物等優(yōu)勢，近年來(lái)已逐漸應用于各種感染性疾病的診斷，對不明原因的危急重感染的病原學(xué)診斷以及新發(fā)突發(fā)傳染病的病原體發(fā)現發(fā)揮了重要作用。

 病原微生物宏基因組基于底層測序技術(shù)的高通量?jì)?yōu)勢，可一次性檢測出樣本中所有種類(lèi)病原微生物測序數據，通過(guò)專(zhuān)門(mén)的病原數據庫比對，獲得疑似致病微生物的種屬信息，為疑難危重感染提供快速精準診斷依據。

mNGS檢測優(yōu)勢

為滿(mǎn)足臨床病原微生物的檢測，進(jìn)一步為疑難危重感染提供快速精準的診斷依據，全式金推出樣本保存、宿主DNA去除、微生物核酸提取及DNA文庫構建相關(guān)產(chǎn)品，提供宏基因組文庫制備的上下游整體解決方案。

樣本保存

TransGuard^? Disposable Virus Sampling Tube

? 滅活病毒，有效防止運輸和檢測過(guò)程中出現二次污染。

? 保存穩定，常溫下保存一周病毒核酸不降解。

? 常溫下運輸和保存，無(wú)需冷鏈。

? 檢出率高，可兼容多種病毒核酸提取試劑。

? 操作簡(jiǎn)便，無(wú)需經(jīng)過(guò)專(zhuān)業(yè)培訓，可自行采樣。

TransGuard^? Fecal DNA Sampling Tube

? 安全滅活，有效防止運輸和檢測過(guò)程中的二次污染。

? 保存穩定，常溫下保存 3 個(gè)月樣本核酸不降解。

? 常溫下運輸和保存，無(wú)需冷鏈。

? 操作簡(jiǎn)便，無(wú)需經(jīng)過(guò)專(zhuān)業(yè)培訓，可自行采樣。

TransGuard^? Buccal Swab DNA Preservation Buffer

? 安全滅活，有效防止運輸和檢測過(guò)程中出現二次污染。

? 保存穩定，常溫下保存 6 個(gè)月樣本核酸不降解。

? 常溫下運輸和保存，無(wú)需冷鏈。

? 操作簡(jiǎn)便，無(wú)需經(jīng)過(guò)專(zhuān)業(yè)培訓，可自行采樣。

宿主核酸去除

TransNGS^? Host DNA Depletion Kit

本產(chǎn)品適用于從血液、肺泡灌洗液、液化痰液、鼻咽或口咽拭子、胸腹水、腦脊液、羊水等生物樣品中差異性裂解人源細胞，并去除人源核酸。

產(chǎn)品特點(diǎn)：

? 簡(jiǎn)便省時(shí)：操作簡(jiǎn)便，50 min完成人源宿主核酸去除。

? 高效去除：專(zhuān)用裂解液，高效去除人源宿主核酸，提高微生物檢出率。

? 兼容多種提取平臺：可兼容柱提法及磁珠法等多種下游提取方式。

? 適用樣本范圍廣：適用于血液、肺泡灌洗液、液化痰液、鼻咽或口咽拭子、胸腹水、腦脊液、羊水等多種生物液體樣本。

高效去除宿主核酸

分別使用TransGen 、Company V和Company Q同類(lèi)產(chǎn)品處理不同樣本，搭配各自適配的柱提法病原微生物核酸提取產(chǎn)品提取核酸，并對宿主保守基因進(jìn)行qPCR定量檢測。結果表明： TransGen 產(chǎn)品可以有效清除宿主核酸，且清除效率顯著(zhù)優(yōu)于 Company V 和 Company Q 同類(lèi)產(chǎn)品。

適用于建庫分析，提高微生物檢出水平

分別以咽拭子、痰液、腹水和胸水去除宿主核酸后提取的產(chǎn)物為樣本，進(jìn)行文庫構建及 PE150 測序分析。結果顯示，TransGen 產(chǎn)品可以顯著(zhù)降低宿主序列占比。

以 TransGen 、Company V 和 Company Q 產(chǎn)品去除咽拭子宿主核酸前、后提取的產(chǎn)物為樣本，進(jìn)行文庫構建及 PE150 測序分析。結果顯示，TransGen 產(chǎn)品可以顯著(zhù)提高微生物檢出水平。

核酸提取

EasyPure^? Microbiome DNA Isolation Kit

本產(chǎn)品采用硅膠膜離心柱特異吸附微生物DNA，分離富集的DNA適用于多種下游應用，包括PCR、qPCR、宏基因組或16S rDNA文庫構建等實(shí)驗。

產(chǎn)品特點(diǎn)：

? 高質(zhì)量、高得率滿(mǎn)足多種下游檢測需求。

? 嚴控試劑背景菌污染，降低假陽(yáng)性風(fēng)險。

? 提取效果好，高、低濃度模板均能獲得高效提取。

? 適用于從適用于從血液、肺泡灌洗液、液化痰液、鼻咽或口咽拭子、胸腹水、腦脊液、羊水等樣本中提取微生物DNA。

將高、低兩種起始量的不同病原菌稀釋液添加至咽拭子、痰液、胸水、腹水樣本中，分別使用TransGen 、Company V 和 Company Q 產(chǎn)品提取核酸，qPCR 檢測提取效果。結果表明：TransGen 產(chǎn)品對不同樣本中不同微生物的提取效率均優(yōu)于競品。

MagicPure^? 32 Microbiome DNA Isolation Kit

本產(chǎn)品利用硅基磁珠特異性吸附微生物DNA，獲得的DNA適用于多種下游應用，包括PCR、qPCR、? 宏基因組或16S rDNA文庫構建等實(shí)驗。

產(chǎn)品特點(diǎn)：

? 高通量提取，操作簡(jiǎn)便，速度快。

? 高質(zhì)量、更高得率滿(mǎn)足多種下游多種檢測需求。

? 更低的試劑背景降低假陽(yáng)性風(fēng)險。

? 適用于32通道磁棒式自動(dòng)化核酸提取儀。

? 適用于從血液、肺泡灌洗液、液化痰液、鼻咽或口咽拭子、胸腹水、腦脊液、羊水等樣本中提取微生物DNA。

將高、低兩種起始量的不同菌種稀釋液添加至咽拭子、痰液、胸水、腹水樣本中，使用 TransGen 柱提法和磁珠法產(chǎn)品提取核酸，qPCR 檢測提取效果。結果表明，TransGen 磁珠法與柱提法產(chǎn)品均可對高、低起始量樣本進(jìn)行高效提取。

文庫構建

TransNGS^? Microbiome DNA Library Prep Kit for Illumina^?

針對Illumina高通量測序平臺開(kāi)發(fā)的，適用于1 ng從血液、肺泡灌洗液、痰液、鼻咽或口咽拭子、胸腹水、腦脊液、羊水等生物樣品中獲取的微生物基因組DNA進(jìn)行文庫制備的試劑盒。

產(chǎn)品特點(diǎn)：

?  建庫用量低：僅需1 ng DNA即可建庫。

?  適用樣本廣泛：血液、痰液、鼻咽或口咽拭子等多種來(lái)源的樣本DNA均可達到較好的建庫效果。

?  建庫時(shí)間短：90 min即可完成文庫構建。

?  無(wú)偏好性：建庫測序結果與預期一致。

宏基因組建庫原理圖

多樣本建庫峰型

使用 TransGen 和 Company V 產(chǎn)品分別以 1 ng 口咽拭子、痰液和血液的基因組為樣本進(jìn)行文庫構建。

臨床模擬樣本建庫

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