Q:Passive Reference Dye的作用是什么,如何使用?
A:它們是針對不同機器型號校正加樣管間誤差的參比熒光染料。它們的濃度為50×,使用時(shí)在20μl體系中加入0.4μl即可。
Q:CT值出現過(guò)晚?
A:可能是擴增效率低,反應條件不夠優(yōu)化。此外PCR各種反應成分的降解或者PCR產(chǎn)物太長(cháng) (一般采用80-250 bp的產(chǎn)物長(cháng)度) 也會(huì )造成CT值出現過(guò)晚。
Q:qPCR SuperMix是否需要調整Mg2+濃度?
A:一般不需要調整,當PCR結果不理想或通過(guò)其它調整不能獲得明顯改善時(shí),可以考慮通過(guò)調整Mg2+濃度以改進(jìn)擴增結果。
Q:擴增曲線(xiàn)異常?
A:
? 基線(xiàn)設置有誤。
? 高濃度的模板會(huì )導致CT值過(guò)早出現,即基線(xiàn)范圍變小,導致機器讀取熒光數值有誤。
Q:重復性差?
A:
? 操作誤差。
? 模板濃度過(guò)低會(huì )導致重復性變差,可適當提高模板濃度,降低稀釋倍數。
? 機器本身的孔間溫度不一致。
Q:NTC不為零,如何優(yōu)化?
A:
? 提高退火溫度。
? 降低引物工作濃度,如需要可降至60 nM。
? 盡量在冰上操作。
? 重新設計引物,必要時(shí)可設計多對引物,優(yōu)中選優(yōu)。