線(xiàn)粒體是細胞的“能量工廠(chǎng)”,在能量穩態(tài)中發(fā)揮重要的作用。線(xiàn)粒體DNA單堿基突變就可導致發(fā)育障礙、神經(jīng)肌肉疾病等多種疾病。開(kāi)發(fā)針對線(xiàn)粒體DNA的基因編輯工具一直是線(xiàn)粒體遺傳學(xué)領(lǐng)域的長(cháng)期目標。DdCBE線(xiàn)粒體堿基編輯器可針對雙鏈線(xiàn)粒體DNA,將C·G堿基對編輯為T(mén)·A堿基對,實(shí)現對線(xiàn)粒體的精準定向編輯。而,一個(gè)的潛在安全隱患是線(xiàn)粒體靶向信號的介導能否保證全部 DdCBE 定位在線(xiàn)粒體中,而不是部分泄露到細胞核,從而造成潛在的脫靶編輯。因此對核基因組脫靶效應及工具本身的安全性評估是極為必要的。
2022年5月12日,北京大學(xué)伊成器團隊在Nature雜志發(fā)表了題為“Mitochondrial base editor induces substantial nuclear off-target mutations”的研究論文。該研究應用了該團隊之前發(fā)表的Detect-seq技術(shù),對DdCBE堿基編輯工具在人類(lèi)細胞中核基因組脫靶編輯進(jìn)行了無(wú)偏向性地評估,并探索了相關(guān)機制,發(fā)現了TAS依賴(lài)型和TAS非依賴(lài)型的脫靶;并意外發(fā)現由細菌毒素 DddA 構成的 DdCBE 堿基編輯工具與維持細胞三維結構的重要蛋白 CTCF有相互作用。本研究對DdCBE堿基編輯工具在基礎研究和疾病治療中的應用具有重要的意義。
優(yōu)質(zhì)的試劑是科學(xué)研究的利器。該團隊在細胞培養的過(guò)程中,使用全式金TransDetect? PCR Mycoplasma Detection Kit對支原體檢測,確保細胞無(wú)支原體污染;在基因克隆實(shí)驗中使用TransStart? FastPfu DNA Polymerase進(jìn)行PCR 片段擴增,并將成功構建的質(zhì)粒轉入Trans1-T1 Phage Resistant化學(xué)感受態(tài)細胞。
TransDetect? PCR Mycoplasma Detection Kit(FM311)
一款高效的PCR法支原體檢測試劑盒,特異性擴增支原體DNA。因操作簡(jiǎn)便、快速(2小時(shí)內即可出結果)、特異性強、靈敏度高的特點(diǎn)備受客戶(hù)喜愛(ài),多次榮登Nature期刊。
產(chǎn)品特點(diǎn):
· 靈敏度高,可檢測低至20個(gè)拷貝的支原體。
· 特異性強,只擴增支原體DNA,真核細胞和細菌DNA不被擴增。
· 操作簡(jiǎn)便,無(wú)需提取基因組DNA,適合大量細胞樣品的檢測。
· 配有陽(yáng)性對照與陰性對照,保證PCR檢測結果的準確性。
TransStart? FastPfu DNA Polymerase(AP221)
一款快速PCR的熱啟動(dòng)高保真DNA聚合酶,克服了普通Pfu酶擴增效率低、產(chǎn)量低和擴增速度慢的缺陷。該產(chǎn)品自上市以來(lái)備受客戶(hù)喜愛(ài),多次榮登Nature、Nature biotechnology、Molecular cell等知名期。
產(chǎn)品特點(diǎn):
· 保真性是EasyTaq? DNA Polymerase的54倍。
· 擴增產(chǎn)物為平端,可直接克隆于pEASY?-Blunt系列載體中。
· 基因組DNA片段的擴增 (≤ 15 kb)。
· Plasmid DNA片段的擴增 (≤ 20 kb)。
Trans1-T1 Phage Resistant Chemically Competent Cell(CD501)
一款經(jīng)特殊工藝制作的化學(xué)感受態(tài)細胞,轉化效率高達109cfu/ug DNA以上。自上市以來(lái)備受客戶(hù)喜愛(ài),轉化效率高、產(chǎn)品性能穩定,多次榮登Nature、Cell等知名期刊。
產(chǎn)品特點(diǎn):
· 生長(cháng)速度快,在氨芐青霉素平板上,8-9小時(shí)可見(jiàn)克隆。
· 用于藍、白斑篩選,12小時(shí)可見(jiàn)藍斑。
· 將過(guò)夜培養的單克隆在2 ml的LB培養基中培養4-5小時(shí)即可進(jìn)行小量質(zhì)粒提取。
· 適用于高效的DNA克隆和質(zhì)粒擴增,減少克隆DNA同源重組的發(fā)生,提高質(zhì)粒DNA的產(chǎn)量和質(zhì)量。
· 具有T1, T5噬菌體抗性。
全式金產(chǎn)品再次登上Nature期刊,證明了大家對全式金產(chǎn)品品質(zhì)和服務(wù)的認可,也完美的詮釋了全式金“品質(zhì)高于一切,精品服務(wù)客戶(hù)”的理念。未來(lái),全式金將繼續秉持“匠心”與“創(chuàng )新”,打造更多精品,助力科學(xué)研究。
使用TransDetect? PCR Mycoplasma Detection Kit(FM311)產(chǎn)品發(fā)表的部分文章:
· Mitochondrial base editor induces substantial nuclear off-target mutations[J]. Nature, 2022.
· Modulating TRADD to restore cellular homeostasis and inhibit apoptosis[J]. Nature, 2020.
· Rapamycin pretreatment rescues the bone marrow AML cell elimination capacity of CAR-T cells[J]. Clinical Cancer Research, 2021.
使用TransStart? FastPfu DNA Polymeras(AP221)產(chǎn)品發(fā)表的部分文章:
· Mitochondrial base editor induces substantial nuclear off-target mutations[J]. Nature, 2022.
· An engineered prime editor with enhanced editing efficiency in plants[J]. Nature Biotechnology, 2022.
· Genome-wide specificity of prime editors in plants[J]. Nature Biotechnology, 2021.
· Precise, predictable multi-nucleotide deletions in rice and wheat using APOBEC–Cas9[J]. Nature Biotechnology, 2020.
· Targeted, random mutagenesis of plant genes with dual cytosine and adenine base editors[J]. Nature biotechnology, 2020.
· Prime genome editing in rice and wheat[J]. Nature biotechnology, 2020.
· Rationally designed APOBEC3B cytosine base editors with improved specificity[J]. Molecular cell, 2020.
· The raphe dopamine system controls the expression of incentive memory[J]. Neuron, 2020.
· Taf14 recognizes a common motif in transcriptional machineries and facilitates their clustering by phase separation[J]. Nature communications, 2020.
使用Trans1-T1 Phage Resistant Chemically Competent Cell(CD501)產(chǎn)品發(fā)表的部分文章:
· Mitochondrial base editor induces substantial nuclear off-target mutations[J]. Nature, 2022.
· Whitefly hijacks a plant detoxification gene that neutralizes plant toxins[J]. Cell, 2021.
· Distinct processing of lncRNAs contributes to non-conserved functions in stem cells[J]. Cell, 2020.
· A defense pathway linking plasma membrane and chloroplasts and co-opted by pathogens[J]. Cell, 2020.
· LDPE microplastics affect soil microbial communities and nitrogen cycling[J]. Science of The Total Environment, 2021.
· Consumption of miRNA-Mediated Insect-Resistant Transgenic Rice Pollen Does Not Harm Apis mellifera Adults[J]. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2021.
· Integrative Proteomic and Phosphoproteomic Analyses of Granulosa Cells During Follicular Atresia in Porcine[J]. Frontiers in cell and developmental biology, 2020.
· Dynamics and Regulations of BimEL Ser65 and Thr112 Phosphorylation in Porcine Granulosa Cells during Follicular Atresia[J]. Cells, 2020.